临床上没有明确表明女性患有慢性肠炎的最佳治疗方法，但通常可采取一般治疗、药物治疗等方法帮助缓解症状。若出现不适症状长期不缓解或逐渐加重时，则建议及时就医，在医生指导下进行针对性治疗。
一、一般治疗
1.ABCD法则：A指休息，即适当卧床休息；B为禁食，即急性发作期需暂时禁止进食；C指补充液体，如遵医嘱静脉滴注葡萄糖注射液、氯化钾缓释片等药物补充体液和离子；D指补充电解质溶液，比如使用复方电解乳(钾)等，以纠正体内水、电解质紊乱的情况。
2.饮食调整：日常生活中注意规律作息，避免熬夜，并且要养成良好的饮食习惯，少吃辛辣刺激性食物，多吃新鲜的蔬菜水果以及易消化的食物，如面条、粥类等。
二、药物治疗
1.抗生素类药物：如果女性患有慢性肠炎是由于细菌感染引起，可在医生指导下服用头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊等抗生素类药物控制炎症。
2.益生菌类药物：如果是肠道菌群失调导致的慢性肠炎，可以遵医嘱应用双歧杆菌三联活菌散调节肠道菌群，改善腹泻、腹胀等症状。
3.止泻药：部分慢性肠炎患者可能会因病原微生物侵袭而出现大便次数增多等情况，此时可以在医生指导下使用蒙脱石散、盐酸洛哌丁胺胶囊等药物起到收敛、止泻的作用。
4.黏膜保护剂：慢性肠炎可能与胃酸分泌过多有关，还可能出现腹痛、反酸等症状，此时可遵医嘱应用硫糖铝咀嚼片、瑞巴派特片等药物保护胃肠黏膜。
5.其他：如果慢性肠炎是由寄生虫感染所造成，还可遵医嘱口服吡喹酮片驱除寄生虫，从而促进病情恢复。
三、手术治疗
对于存在严重肠梗阻或其他并发症的慢性肠炎女性，必要时可通过开腹将病变部位切除后吻合，或者通过内镜逆行胰胆管造影术取出结石等方式进行治疗。
